多国发现新冠病毒变异毒株，意味着什么？ -

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近段时间，一直有新的新冠变异毒株被发现报道，比如之前在马来西亚现有的新冠肺炎确诊病例中确认了4例D614G变异毒株（这一变异毒株传播速度可能比一般毒株快10倍）。其中引起比较大反响的是8月份在印度发现的73个毒株新变种。据央视新闻消息，据印度报业托拉斯15日报道，印度当地研究人员在东部奥里萨邦发现了73个新冠病毒的新型变种。该研究团队的首席研究员达斯博士（Dr. Jayashankar Das）表示，研究团队对包括752个临床样本在内的1536个样本进行了测序，最终首次在印度报告了两个新的病毒谱系。报道称，研究团队发现了73个新冠病毒毒株的新变种。达斯还补充说，了解新冠病毒的详细特征对于治愈新冠肺炎患者很有帮助。这项研究将有助于了解新冠毒株的脆弱性，以及印度东部，尤其是奥里萨邦的病毒变异动态。

那对于病毒频繁产生变异的现象，很多朋友可能只是一味的感到恐惧，对此，我们又该如何理解和应对呢？这篇文章，浩哥就来科普一下这个问题。

「病毒变异罕见吗？」

其实所谓变异，本质上就是基因序列出现的变化，不仅仅是病毒，即便是我们人类，无时无刻也都有细胞发生着序列变化（只不过绝大部分变异都是没有意义的，随着细胞的自然凋亡就会消失，只有极极极极少数的变异会对人体产生影响，比如肿瘤的产生）。因此，新冠变异并不奇怪，本来就是RNA病毒，加上目前感染数量已经如此巨大，不变异才有鬼。但其实我们关注变异的本身，是变异会对新的毒株带来怎样的表型变化（就是那些极少数产生作用的病毒序列变异，比如毒性增强，传播性增强等）？

对于印度发现的病毒变异，我去查了下材料，关于这个事件的原文报道，目前能收到的只有两个媒体报道链接，一个是the times of India, 一个是The new indian express。

浩哥接着去GISAID数据搜了下，本来想查一下，有没有这73个病毒毒株的序列数据，无奈现在没有研究所邮箱了，公司邮箱申请的账号还没过审。所以，只有退而求其次，去查了下GISAID上的新冠的流行病学传播工具。不巧，即便数据库已经更新到十月份的数据了，但印度的数据（下图的绿点）还集中在中部，并没有奥里萨邦的数据（ODISHA，红色方框），所以推测应该是还没有上传到数据库。

所以，浩哥只能从媒体报道的内容里，尝试寻找一些信息了，当然也发现了一些亮点。首先，我们看到，媒体采访的印方研究所负责人说，从这1536个样本中发现的新的新冠变异株系主要是B.112和B.199。

给大家简单说一下目前全球新冠毒株的谱系分类吧，按GISAID上的官方描述，目前全球的新冠病毒序列，主要可分成六大分支（下图，S,L,V,G,GR,GH），其中S,L,V株系是19年出现的（所以前边有19的数字），而G,GR,GH三个株系是今年才出现的（名字有20的数字），所以我们看到，按印方负责人说的，这次新发现的毒株是B.112和B.199株系，那对应的就属于GR和GH的分支。

那这两个分支有什么特别的呢？从下图我们可以看到，在已发现的病毒序列中，GH和GR都包含有S-D614G这种病毒型。

那D614G病毒型为什么如此‘臭名昭著’呢？

因为它是一个将新冠传染性带到一个新高度的变异型，这种病毒型，从今年2月份以来开始在全球爆发，如今已经成为全球最常见的一种新冠病毒型[1][2][3][4]。而正是由于这种病毒型的突变，改变了原病毒型（D614）的氨基酸序列，将原来的614位天冬氨酸（缩写为D）变成了甘氨酸（缩写为G），导致了这种病毒型的传染性进一步增强。这也是这种病毒型取名为D614G的原因。

「病毒变异对我国防控的影响」

通过上文，大家应该已经清楚了，病毒的序列变异是非常正常的，新型的毒株可能一直都在产生，但大部分新型毒株其实并没有特别的表型表换，所以大家其实不用过于恐慌。至于对于我国的防控工作，浩哥觉得保持常规操作即可，但从另一层面也需要密切关注这些新型病毒型后续的表型，有没有特殊的变化，另外边境的管控也要尤其注意，毕竟最近云南瑞丽的疫情复发也是由于偷渡引起的，虽然奥里萨邦离我们也不远，但对其它国家的进出管控也更为关键，因为貌似7月份，美印就通航了......

参考文献：

1. Tang, L.; Schulkins, A.; Chen, C.; Deshayes, K.; Kenney, J.S. The SARS-CoV-2 Spike Protein D614G Mutation Shows Increasing Dominance and May Confer a Structural Advantage to the Furin Cleavage Domain. Preprints 2020, 2020050407 (doi: 10.20944/preprints202005.0407.v1).

2. Maitra A , Sarkar M C , Raheja H , et al. Mutations in SARS-CoV-2 viral RNA identified in Eastern India: Possible implications for the ongoing outbreak in India and impact on viral structure and host susceptibility[J]. Journal of Bioences, 2020, 45(1)

3. The D614G mutation of SARS-CoV-2 spike protein enhances viral infectivity and decreases neutralization sensitivity to individual convalescent sera DO - 10.1101/2020.06.20.161323

4. Koyama T , Weeraratne D , Snowdon J L , et al. Emergence of Drift Variants That May Affect COVID-19 Vaccine Development and Antibody Treatment[J]. Pathogens, 2020, 9(5):324.

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